Kemangkatan Glang Darma mengakibatkan perbalahan tentang adakah Putera Yumtän (Wylie: Yum brtan) atau Ösung (Wylie: 'Od-srung) (843-905 atau 847-885), lagi seorang putera atau mungkin juga anak saudara lelaki kepada Glang Darma, harus merupakan pewaris. Kedua-dua orang itu dilahirkan selepas kemangkatan Glang Darma. Sebuah perang saudara yang berikutan mengakhiri secara berkesan pentadbiran terpusat Tibet sehingga zaman Sa-skya. Sekutu-sekutu Ösung dapat menguasai Lhasa, tetapi Yumtän terpaksa bertolak ke Yalung dan di sana, beliau mengasaskan jurai keturunan raja yang berasingan. [25] Pada tahun 910, makam-makam maharaja dicemarkan.

Pälkhortsän (Wylie: Dpal 'khor brtsan) (893-923 atau 865-895), putera kepada Ösung, kelihatan menguasai kebanyakan kawasan Tibet tengah buat sementara waktu dan melahirkan dua orang anak lelaki, iaitu Trashi Tsentsän (Wylie: Bkra shis brtsen brtsan) dan Thrikhyiding (Wylie: Khri khyi lding, juga dikenali sebagai Kyide Nyigön [Wylie: Skyid lde nyi ma mgon] dalam sebilangan sumber). Thrikhyiding berhijrah ke arah hulu Sungai Ngari (Wylie: Stod Mnga ris) di Tibet barat dan selepas berkahwin dengan seorang wanita bangsawan Tibet di sana, mereka bersama-sama mengasaskan sebuah dinasti tempatan. [26]

Selepas perpecahan empayar Tibet pada tahun 842, Nyima-Gon, salah seorang ahli kerabat diraja kuno Tibet, mengasaskan dinasti Ladakh yang pertama. Pusat kemaharajaan Nyima-Gon terletak jauh di timur Ladakh masa kini. Anak sulung Kyide Nyigön menjadi raja Mar-yul (Ladakh), manakala dua orang putera yang lebih muda memerintah Tibet barat dan mengasaskan Kemaharajaan Guge serta Kemaharajaan Pu-hrang. Pada tempoh kemudian, Kor-re, anak sulung kepada raja Guge, juga dikenali sebagai Jangchub Yeshe Ö (Byang Chub Ye shes' Od), menjadi sami agama Buddha. Beliau menghantar cendekiawan-cendekiawan muda ke Kashmir untuk dilatih dan merupakan tokoh yang menjemput Atisha ke Tibet pada tahun 1040. Dengan itu, Kor-re memulakan apa yang dipanggil fasa Chidar (Phyi dar) dalam agama Buddha di Tibet. Srong-nge, putera yang lebih muda kepada raja Guge, menangani hal-ehwal harian kerajaan dan adalah jurai keturunannya yang melanjutkan jurai keturunan raja Guge. [27]

Pemerintahan terpusat hampir tidak wujud di kawasan Tibet antara tahun 842 hingga 1247, dan agama Buddha dapat wujud secara curi-curi di kawasan Kham. Semasa pemerintahan Glang Darma, tiga orang sami melarikan diri dari kawasan Lhasa yang bermasalah ke kawasan Gunung Dantig di Amdo. Mu-zu gSal-'bar, pengikut mereka yang kemudian dikenali sebagai cendekiawan Gongpa Rabsal (Dgongs-pa rab-gsal) (832-915), bertanggungjawab untuk memulakan semula agama Buddha di Tibet timur laut dan dianggap sebagai pengasas mazhab Nyingma (Rnying ma pa) dalam agama Buddha Tibet. Semasa itu, menurut tradisi, salah seorang keturunan Ösung yang memiliki ladang berdekatan Samye menghantar sepuluh orang pemuda untuk dilatih oleh Gongpa Rabsal. Antara pemuda tersebut ialah Lume Sherab Tshulthrim (Klu-mes Shes-rab Tshul-khrims) (950-1015). Setelah dilatih, pemuda-pemuda itu ditahbiskan dan dikembalikan ke U dan Tsang di Tibet tengah. Cendekiawan-cendekiawan yang muda itu dapat berhubung dengan Atisha tidak lama selepas tahun 1042 dan meningkat maju penyebaran dan penyusunan agama Buddha di Lhokha. Di kawasan tersebut, agama Buddha akhirnya bergabung semula, dengan penubuhan Biara Sakya pada tahun 1073. [28] Pada sepanjang dua abad yang berikut, biara Sakya bertumbuh sehingga mencapai suatu kedudukan yang ketara dalam hidup dan kebudayaan Tibet. Biara Tsurpu, tempat asal mazhab Karmapa Buddhisme, diasaskan pada tahun 1155.